- Genetické a fyziologické manipulace s bakteriálními degradéry aromatických polutantů a jejich využití
- Remediace podzemních vod s využitím permeabilních reaktivních bariér
- Vliv nově přidávaných biosložek na osud a chování pohonných hmot v životním prostřední v případě havarijní situace
- Využití genomiky a genetického inženýrství pro vyhledávání a přípravu genotypů rostlin schopných degradovat kontaminanty životního prostředí
- Výzkum a vývoj kombinovaného biofiltru pro čištění odpadních plynů a vod z živočišných výrob
- Výzkum a vývoj modifikovaných metod biodegradace organických kontaminantů a metody detekce stupně biodegradace pomocí biomarkerů

